seibun テーブルは正常なので、ACFinder のテーブルリレーションに問題がありそうです。それ以上の原因追及はまだしていませんが、とりあえず対症療法としては

SELECT ippanmei, seibun, keito,koka, JPP系統名, kagakumei,nodo, nodochu, gyodoku, dokusei, jyogai1, jyogai2, biko FROM tvSeibun as a WHERE bango = ...

の部分を

SELECT DISTINCT ippanmei, seibun, keito,koka, JPP系統名, kagakumei,nodo, nodochu, gyodoku, dokusei, jyogai1, jyogai2, biko FROM tvSeibun as a WHERE bango = ...

にすればいけますね。